屋頂花園設計一般是不能直接種植的，一些設計師會硬性模仿地面種植方式，直接在屋頂填上200~400mm厚的土壤，這會加重屋面的負載，引起各種屋面頂板的梁板配筋或結構的增加。所以屋面花園等綠化建筑應當選擇輕型栽培基質，如蛭石、珍珠巖、細沙、山沙、人工石、木渣、碎屑等，為了增加人工土壤基質的肥效，也可加些泥炭，要求比重在180kg/m2以下。

在屋頂種什么東西也存在如何讓植物存活的問題。應當區分屋頂與地面種植的區別，不能照搬在地面上的種植技術，要有屋頂綠化的先進理念。在如此淺薄的土層上種植花草，需要配有完善的灌溉和排水系統。

屋頂灌溉系統主要克服的是上要灌水,下要排水。人工土層只有200~300mm，多用一點水，大多數都跑到排水溝里去了，造成浪費。如采用普通的人工澆灌方式不符合實際，人力、用水、澆灌時間、對土壤沖洗嚴重等都是問題。針對屋頂灌溉系統，采用微噴是較好的一個辦法，噴水量小，剛好滿足植物需求，浪費少。

但由于屋頂光照強烈，蒸發量大，而且樓頂屋面遠離水源，能夠采用的水源有限，常常因上水管出口小，壓力低而缺水。因此，采用微噴也許并不是最好的辦法。所以，最佳方案是選用能夠使水橫著走的滴灌產品-滴管毯。